Program hodowli żyta prowadzony jest w kierunku uzyskania odmian plennych, odpornych na wyleganie, porastanie oraz choroby, o bardzo dobrych zdolnościach adaptacyjnych i przydatnych do wypieku chleba żytniego dobrej jakości. W DANKO wielką uwagę przywiązuje się do hodowli zachowawczej odmian, co pozwala na długoletnie utrzymanie ich w uprawie.
Najnowszą taką odmianą populacyjną żyta hodowli DANKO jest odmiana Dańkowskie Amber. Wyróżnia się ona bardzo dobrą plennością oraz dobrą odpornością na wyleganie, przewyższającą hybrydowe odmiany wzorcowe. Poza tym cechuje ją dobra odporność na większość chorób żyta, szczególnie na mączniaka i choroby podstawy źdźbła. Jest odmianą wczesną, sprawdzającą  się na glebach ubogich w wodę. Ziarno tej odmiany charakteryzuje podwyższona zawartość białka i bardzo dobra wydajność mąki.  Na uwagę zasługuje również odmiana Dańkowskie Diament o wysokim poziomie plonowania, odporności na wyleganie oraz dużej tolerancji na zakwaszenie gleby. Ziarno  jest wyrównane, o dużej masie 1000 nasion, wysokiej liczbie opadania, dużej zawartości białka oraz dobrej wartości przemiałowej.
Program hodowli żyta w DANKO obejmuje również hodowlę mieszańców heterozyjnych. We współpracy z Poznańską Hodowlą Roślin wyhodowano dwie takie odmiany Nawid i Gradan. Charakteryzują się dużą odpornością na mączniaka, krótszym, bardzo odpornym na wyleganie źdźbłem oraz dużym, wyrównanym i odpornym na porastanie ziarnem.
Odmiany żyta firmy DANKO cieszą się dużym powodzeniem za granicą.